Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
5730522E02RikQ5SP45 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5730522E02RikQ5SP45 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms