Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV8

Pfpl, Pfpl protein, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfplQ5RKV8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PfplQ5RKV8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PfplQ5RKV8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PfplQ5RKV8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms