Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PkdccQ5RJI4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PkdccQ5RJI4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PkdccQ5RJI4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms