Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trdv2-2Q5R1A4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trdv2-2Q5R1A4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms