Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vmn1r209Q5NC97 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r209Q5NC97 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vmn1r209Q5NC97 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r209Q5NC97 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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