Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Znf354cQ571J5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf354cQ571J5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf354cQ571J5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf354cQ571J5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms