Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc47Q505F5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc47Q505F5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc47Q505F5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc47Q505F5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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