Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phactr4Q501J7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phactr4Q501J7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phactr4Q501J7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phactr4Q501J7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms