Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc84Q4VA36 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc84Q4VA36 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc84Q4VA36 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc84Q4VA36 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms