Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc3lQ4KL14 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc3lQ4KL14 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trappc3lQ4KL14 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc3lQ4KL14 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc3lQ4KL14 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trappc3lQ4KL14 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc3lQ4KL14 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc3lQ4KL14 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc3lQ4KL14 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc3lQ4KL14 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc3lQ4KL14 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc3lQ4KL14 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trappc3lQ4KL14 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trappc3lQ4KL14 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms