Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ddx49Q4FZF3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx49Q4FZF3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx49Q4FZF3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ddx49Q4FZF3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx49Q4FZF3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx49Q4FZF3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx49Q4FZF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx49Q4FZF3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx49Q4FZF3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx49Q4FZF3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx49Q4FZF3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms