Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim80Q3V061 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim80Q3V061 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim80Q3V061 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim80Q3V061 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms