Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc160Q3UYG1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc160Q3UYG1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc160Q3UYG1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc160Q3UYG1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms