Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY34

Uncharacterized protein C12orf43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UY34 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UY34 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3UY34 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UY34 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UY34 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3UY34 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UY34 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UY34 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UY34 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UY34 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UY34 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UY34 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UY34 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UY34 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3UY34 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UY34 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3UY34 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3UY34 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3UY34 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3UY34 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3UY34 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3UY34 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3UY34 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UY34 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UY34 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UY34 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UY34 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UY34 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UY34 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UY34 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UY34 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UY34 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UY34 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3UY34 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3UY34 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3UY34 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3UY34 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3UY34 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3UY34 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3UY34 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3UY34 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3UY34 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3UY34 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3UY34 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3UY34 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3UY34 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3UY34 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3UY34 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3UY34 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3UY34 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3UY34 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3UY34 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3UY34 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3UY34 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UY34 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UY34 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UY34 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UY34 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UY34 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3UY34 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UY34 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UY34 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UY34 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UY34 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UY34 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3UY34 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UY34 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UY34 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UY34 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3UY34 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UY34 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UY34 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UY34 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UY34 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UY34 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3UY34 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UY34 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3UY34 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q3UY34 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UY34 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UY34 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UY34 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UY34 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UY34 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UY34 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3UY34 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UY34 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UY34 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UY34 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q3UY34 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UY34 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UY34 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UY34 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UY34 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UY34 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UY34 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q3UY34 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UY34 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UY34 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q3UY34 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms