Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mbd3l2Q3UXB0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd3l2Q3UXB0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms