Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pfdn4Q3UWL8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pfdn4Q3UWL8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pfdn4Q3UWL8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms