Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TceancQ3US16 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TceancQ3US16 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TceancQ3US16 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TceancQ3US16 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms