Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zscan4fQ3URS2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zscan4fQ3URS2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zscan4fQ3URS2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zscan4fQ3URS2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zscan4fQ3URS2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zscan4fQ3URS2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zscan4fQ3URS2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zscan4fQ3URS2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms