Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vwa5b2Q3UR50 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vwa5b2Q3UR50 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vwa5b2Q3UR50 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.3 ms