Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mindy4Q3UQI9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mindy4Q3UQI9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mindy4Q3UQI9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mindy4Q3UQI9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy4Q3UQI9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms