Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
D13Ertd608eQ3UPR8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms