Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrc4Q3UP24 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrc4Q3UP24 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrc4Q3UP24 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrc4Q3UP24 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms