Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cobll1Q3UMF0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cobll1Q3UMF0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cobll1Q3UMF0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms