Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CrxosQ3UL53 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CrxosQ3UL53 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CrxosQ3UL53 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CrxosQ3UL53 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CrxosQ3UL53 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CrxosQ3UL53 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrxosQ3UL53 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrxosQ3UL53 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrxosQ3UL53 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrxosQ3UL53 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrxosQ3UL53 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrxosQ3UL53 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CrxosQ3UL53 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms