Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpr55Q3UJF0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpr55Q3UJF0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gpr55Q3UJF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpr55Q3UJF0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms