Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LbrQ3U9G9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LbrQ3U9G9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LbrQ3U9G9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LbrQ3U9G9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LbrQ3U9G9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms