Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3W5

Prmt9, Protein arginine N-methyltransferase 9, mousemouse

Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt9Q3U3W5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prmt9Q3U3W5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prmt9Q3U3W5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prmt9Q3U3W5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prmt9Q3U3W5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prmt9Q3U3W5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prmt9Q3U3W5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prmt9Q3U3W5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prmt9Q3U3W5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prmt9Q3U3W5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prmt9Q3U3W5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms