Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tbc1d2bQ3U0J8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tbc1d2bQ3U0J8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tbc1d2bQ3U0J8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tbc1d2bQ3U0J8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms