Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pbxip1Q3TVI8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pbxip1Q3TVI8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pbxip1Q3TVI8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbxip1Q3TVI8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms