Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Ccdc136Q3TVA9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
Ccdc136Q3TVA9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Ccdc136Q3TVA9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC39■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Ccdc136Q3TVA9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Ccdc136Q3TVA9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Ccdc136Q3TVA9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms