Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam172aQ3TNH5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam172aQ3TNH5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam172aQ3TNH5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms