Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc10Q3TLI0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trappc10Q3TLI0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trappc10Q3TLI0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc10Q3TLI0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms