Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cwc27Q3TKY6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cwc27Q3TKY6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cwc27Q3TKY6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cwc27Q3TKY6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cwc27Q3TKY6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms