Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc69Q3TCJ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc69Q3TCJ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc69Q3TCJ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc69Q3TCJ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms