Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBT3

Tmem173, Stimulator of interferon genes protein, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem173Q3TBT3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem173Q3TBT3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem173Q3TBT3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem173Q3TBT3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem173Q3TBT3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem173Q3TBT3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem173Q3TBT3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem173Q3TBT3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem173Q3TBT3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem173Q3TBT3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem173Q3TBT3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem173Q3TBT3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem173Q3TBT3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem173Q3TBT3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem173Q3TBT3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem173Q3TBT3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem173Q3TBT3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem173Q3TBT3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem173Q3TBT3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem173Q3TBT3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem173Q3TBT3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem173Q3TBT3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem173Q3TBT3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem173Q3TBT3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem173Q3TBT3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms