Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccbe1Q3MI99 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccbe1Q3MI99 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccbe1Q3MI99 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms