Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3KNL4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3KNL4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3KNL4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3KNL4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3KNL4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3KNL4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3KNL4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3KNL4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3KNL4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3KNL4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3KNL4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3KNL4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3KNL4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3KNL4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3KNL4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3KNL4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms