Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3X8

Phactr1, Phosphatase and actin regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr1Q2M3X8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phactr1Q2M3X8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phactr1Q2M3X8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phactr1Q2M3X8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phactr1Q2M3X8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phactr1Q2M3X8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phactr1Q2M3X8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phactr1Q2M3X8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phactr1Q2M3X8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Phactr1Q2M3X8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phactr1Q2M3X8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phactr1Q2M3X8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms