Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim71Q1PSW8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim71Q1PSW8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim71Q1PSW8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim71Q1PSW8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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