Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpusd2Q149F1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpusd2Q149F1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rpusd2Q149F1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpusd2Q149F1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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