Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Gli2Q0VGT2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Gli2Q0VGT2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gli2Q0VGT2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gli2Q0VGT2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gli2Q0VGT2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Gli2Q0VGT2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Gli2Q0VGT2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gli2Q0VGT2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gli2Q0VGT2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gli2Q0VGT2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Gli2Q0VGT2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Gli2Q0VGT2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gli2Q0VGT2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gli2Q0VGT2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gli2Q0VGT2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gli2Q0VGT2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Gli2Q0VGT2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gli2Q0VGT2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gli2Q0VGT2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Gli2Q0VGT2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Gli2Q0VGT2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Gli2Q0VGT2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Gli2Q0VGT2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Gli2Q0VGT2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms