Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc162pQ0VG85 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc162pQ0VG85 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc162pQ0VG85 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms