Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samd12Q0VE29 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Samd12Q0VE29 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Samd12Q0VE29 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms