Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBN2

Dsel, Dermatan-sulfate epimerase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DselQ0VBN2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
DselQ0VBN2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DselQ0VBN2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DselQ0VBN2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms