Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tigd2Q0VBL1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tigd2Q0VBL1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tigd2Q0VBL1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tigd2Q0VBL1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tigd2Q0VBL1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tigd2Q0VBL1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tigd2Q0VBL1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tigd2Q0VBL1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tigd2Q0VBL1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tigd2Q0VBL1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tigd2Q0VBL1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tigd2Q0VBL1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tigd2Q0VBL1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd2Q0VBL1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd2Q0VBL1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms