Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem52bQ0VBF2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem52bQ0VBF2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem52bQ0VBF2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms