Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,04■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC33,02■■■□□ 2,88
Vps8Q0P5W1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32,99■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,98■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32,97■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,87
Vps8Q0P5W1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC32,95■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,95■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32,94■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32,94■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32,94■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,92■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32,89■■■□□ 2,86
Vps8Q0P5W1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32,87■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32,85■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32,85■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32,84■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Vps8Q0P5W1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,76■■■□□ 2,84
Vps8Q0P5W1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32,76■■■□□ 2,83
Vps8Q0P5W1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,76■■■□□ 2,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,7 ms