Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrioQ0KL02 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TrioQ0KL02 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TrioQ0KL02 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms