Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ubxn2bQ0KL01 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ubxn2bQ0KL01 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ubxn2bQ0KL01 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ubxn2bQ0KL01 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms