Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q08AU9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q08AU9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q08AU9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q08AU9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q08AU9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q08AU9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q08AU9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q08AU9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q08AU9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q08AU9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q08AU9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q08AU9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q08AU9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q08AU9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q08AU9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q08AU9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q08AU9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q08AU9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q08AU9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q08AU9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q08AU9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q08AU9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q08AU9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q08AU9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q08AU9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Q08AU9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q08AU9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q08AU9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q08AU9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q08AU9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q08AU9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Q08AU9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q08AU9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q08AU9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q08AU9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q08AU9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q08AU9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q08AU9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q08AU9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q08AU9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q08AU9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q08AU9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q08AU9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q08AU9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q08AU9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q08AU9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q08AU9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q08AU9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q08AU9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q08AU9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q08AU9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q08AU9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q08AU9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q08AU9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q08AU9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q08AU9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q08AU9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q08AU9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q08AU9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q08AU9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q08AU9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q08AU9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q08AU9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q08AU9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q08AU9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q08AU9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q08AU9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q08AU9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q08AU9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q08AU9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q08AU9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q08AU9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q08AU9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q08AU9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q08AU9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q08AU9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q08AU9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q08AU9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q08AU9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q08AU9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q08AU9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q08AU9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q08AU9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q08AU9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q08AU9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q08AU9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q08AU9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q08AU9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q08AU9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q08AU9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q08AU9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q08AU9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q08AU9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q08AU9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q08AU9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q08AU9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q08AU9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q08AU9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q08AU9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms